虽然说医用防护服比隔离衣要好，但成本相对高，所以针对不同工作岗位，选择的防护服也就有所区别。
功能不同
医用防护服是临床医务人员在接触甲类或按甲类传染病管理的传染病患者时所穿的医用防护用品。隔离衣是用于医务人员在接触避免受到血液、体液和其他感染性物质污染，或用于保护患者避免感染的防护用品。
使用者指征不同
穿隔离衣：
1、接触经接触传播的感染性疾病患者如传病病患者、多药耐药菌感染患者等时。
2、对患者实行保护性隔离时，如大面积烧伤患者、骨随移植患者的诊疗、护理时。
3、可能受到患者血液、体液、分泌物、排汇物喷溅时。
4、进入重点部门如ICU、NICU、保护性病房等，是否需穿隔离衣，应视医务人员进入目的及与患者接触状况，够的内部规定。
穿医用防护服：
接触经空气传播和飞沫传播的传染病患者，可能受到患者血液、体液、分泌物、排汇物喷溅时。
使用对象不同
医用防护服是防止医护人员被感染，属于单向隔离，主要针对的医护人员；而隔离衣是既防止医护人员被感染或污染又防止病人被感染，属于双向隔离。
医用防护服相对隔离衣的优势
1、医用防护服还是医用防护用品里一个重要的组成部分，它的基本要求是阻隔病毒、细菌等有害物质，从而保护医护人员在诊疗、护理过程中不被感染。
2、医用防护服还要满足正常的使用功能要求，有较好的穿着舒适性和安全性，例如具有较好的透湿性、阻燃性能和耐酒精腐蚀性能等。
3、医用防护服具有抗渗透功能、透气性好、强力高和高耐静水压的特点，主要应用于工业、电子、医疗、防化和防细菌感染等环境下使用。
正规合格的医用防护服和隔离衣都必须经环氧乙烷灭菌处理，并控制其残留，对人体无毒副影响，且符合国家医疗器械生产要求。
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